Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN05481
ATGACATGATGTATCCAAGATCATCGAGTTTGGCGACAAATACATAGCATTTACTGATTTTGGGTATATGAAGAACATTTGAAAGAGTCAACAC
CTTGTCTGTGTCTAATCGAATCACCACTGTACCAATCCCAGCTACATCAACATGATCATTGTTGTCCAAAATCACCTCGTGATCTTTCATTGGG
TTGTAGTCCACAAACATGTCCCTAGAGTAGCAAACATGCTCTGAAGAACCACAATTCAAGTACCAGCCTTGAGCCTTGTTGTTGGATCGAGTCC
CGCAGCCTATTATTGCCTTAAGCACCACTTTCTCAATCTCAGTCCTCGTGGCTTTGGAATGTGGCATGTTCATTCTATATTTTATAAGCCTTGA
GGAAGATACTCCCACCAGAACCACCTCCACCTTTCGTACCACCGTCCCCTCCTTCCGCCAACAACCTATGTCTTGGTTGTCTCGGCTCTCACCC
TCGGCTCTCGCTCTCGGCTAACACAGGATTAACTTCCGTTAGCTGTGATGGAAGAAAAAGTGGGGAAGAAGATGAGGATTTAAACAATAGAAGG
GTTGAGAAAAGAATTAAAAATGAGAGGAGGAGGGGTCGTGCACAGTGGTGCTCGTGTGGGATGTTAGCTGTGGTGGTGGTGGTGTTAGCAAGTG
GTGGAGGTGGTGGATATGTTGGTGGTGGTGGTGCAGTG

Primers for UN05481 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CCGCCAACAACCTATGTCTT 59.99320CCAACATATCCACCACCTCC 60.0520250 431680
2CCGCCAACAACCTATGTCTT 59.99320CACCACCAACATATCCACCA 60.08820255 431685
3CCGCCAACAACCTATGTCTT 59.99320CACCACCACCAACATATCCA 60.08820258 431688