Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN86412
CTGATGGGTCGGGTTGTTGTCCTCACACCAACCCGACCCATCAAAGAACATATTATTATTAGTCCCACTACTATTCCCATTCCCACTATTGTGA
CTATGGCCATGGTGGTTATGCATAATAGGATCTTGAAATGATTGAAGTGACAACCTAAGATCTTGACTCTGATTAAACTGATGCATATCCGCAC
TAGAAGTATTATTCGGCCCATTCGAAGAAGCACCCATAGGAAAAAAAGACTTAATAGTATCAGCAATGGAATCTTGGTCAAGTGAAGGAGGCAA
AAAGCTTTCATTACCATTTTCATCACCTGGGTACTCTTGAATTCCAATTCCCTGATCTGGGTCTTGCTCGAAATTCAAATTCGATGTCGAAATC
TCGTTTCTTGAACCATTACTAGGTTTCCAAGCTGGCAGCTGAGCAAGTTCATCAATGGCAGTTTTAGCTTTTTTAATAAGCCAGTCAACTGCTT
TACTAGGTCTATCATAACCTAAACGGTCTTGTACATCATAGAATTGTATAGCAGTATGTGCTGATAAACGCACGCGCCTGTCGCGTGGGCCTTT
TGCTGTACAAACTTTACTATGTCTGTCTTTCCGACCAGTTGACCGGACAATGTGACCACCTTGTACTTGGACTATTTCTCCACCTGTGTTTGAT
GTTCTTAAGGCTAATCTTGATGACCCTTGTTGTTGTTGTTGTTGATGTTGCTGATGTTGTTGTGCTAGCATGACCATGTTCCTTCTAGCCATAA
GTAGCTCGGCACGTTGAGCATCGATGTTGTTTTGTTGAGCAAAATGTGGACCAAAAAGACCATGAATGTTTGGTTGTTGTGGGGTGTTTGTGAT
GATGGTGGGGTCCACAATGTTCATGTTTTTGTTGTATGACTGAGCCACTACTCTTGCTGG

Primers for UN86412 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GTCTTTCCGACCAGTTGACC 59.55520ACCCCACAACAACCAAACAT 59.98920249 589837
2GGGCCTTTTGCTGTACAAAC 59.61520TTTGGTCCACATTTTGCTCA 60.08820251 557807
3GTCTTTCCGACCAGTTGACC 59.55520TTTGGTCCACATTTTGCTCA 60.08820219 589807