Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN04962
GGGAGTTTTACTGTTAATTAATAATATAAATCAATATTGGTGATTTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTAAAGTTTCTAATTTCTGCTTTTATAATAA
TAATAATAATAATAATTGCAACATTACAAATATAGCAGTAACAGGAATGTTTGGATTATTGAGTATTGATTGAGTACATAAATTGAACAGCACT
CCACAGTATCCATCACCTCAAATAACTCTCATTAATTTCCATTTCAACATCAAGACCAGTGTATTTACACAAATGCCTAGCGTATGGGAATCTT
CAGCTCTAAAAACAGGACCAACCACAAATACACGTTGAAAATCACCAGAGATTGCCATTTGCTTGTGAAGCTGAGGCGACTGTGCTAAACATGC
TGGCTGATTTTTGTACTCAAAATTGAAAATAGCTGCTCCACCTTCGCTAGTGCCTGCAATTATCATTGGAGTGTCGATTTCGCAAAAACCTTTA
CTCAGCAACAACTGCCCAAATAAATTTTTCACTTGGCCTTAAAGCGAAAAACCGCTTCCCTTGCTGGTGCTCGCATAGCCAAAACTATATTGTC
CAAGAGTGTGTCCTCCAAATTCTCAAATTCAACTTCACTTCTAGACGCATCCTCATAAGTAATATGACGCTTAGTAGCAGATCTGCTTATGCAA
TGAATCTTCCTCACAAGTACTTCAACCTGTCATTGATTGAAGCTCTTTGACAGGAATGTCACCATAGTTGGCAGCACTTAGGATCATGTTCTGC
CATTGATTGAAGCTCTTTGACACCAAAACAGTTGTGTGTCATTCAAAAGAAACTTCTGCTTATTTGCTTATTCAAAATCAAAATCAGCAGTTTC
TAACCATGACGCTCCATGAGAAATATCTTAATATCGAGTTTTGGGTTACAAAAAGGTGGAAAGCGTGTTGTACCTGCTTCCCATATGCGAGAGA
CCAATGCAACAGGAAACCAACAAAATGGAGCTCAAGCCGATGGGTTGGCTAATCAGAATATTTCAGTTCACCCATCACTATTAGCGCCACCGTC
TTCACCCACATCTTTTACCAACTATGCACTTCAATCTACGGCCCAATCACTCTGTTTTCTATCAGCAAACTCACCTGGTGGTCCATCTAACATA
ATGTTTGCCGCTCGGCCATACGCCCACGAAACCAACCTTGTATCTCCACCTGTATTCTCAACCTTCACCACCGAGCCATGAATGTCCCCAAACA
TTAAAATGATTATGATCGATGCTTATGAAATCCTGCAACTTGAACTCCCGACAATCACAATCAGCAATGTGGTGGTGCACTCTTATATCATGAA
CAGTCTCCTTGCTCCTTGGTTTGAGCCCCCATCATGCTCCATATCACTTCTTTCTCAGCCCACCTCCAACCTAAGGTCCATCCGGGAGGCGAGA
CATGGCGGTATTGATGGAAATTATACATTGTAACGACTGCAACGTAGCCATCAGGGGTCCAACTAATGATATCCCACTTGATTGTGATGTTTCC
ATTTGGGTCAAGTGCATCATACGCTTCTGTGGAAGTAAAACTGAATGAAGAAAGCAATATAGCAACAACAATGGTGGAAAGTGACAATCTTGTT
AAAGATCTGAAGCAGTAATCCATGATTACTTGCTTCAAAGGTTTCCAAGATCCGACAGTGTGTTTTAAGTGTGTGTGTGTGTTTTTAGTGTGTG
TGTGAGAGAAATATTGAGAGATGTGGGAGTGAGTGTCTTT

Primers for UN04962 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GCATCATACGCTTCTGTGGA 59.8320CACTCACTCCCACATCTCTCA 58.81821210 15181727
2GCATCATACGCTTCTGTGGA 59.8320ACACTCACTCCCACATCTCTCA 59.75622211 15181728
3TGATGTTTCCATTTGGGTCA 59.7520CACTCACTCCCACATCTCTCA 58.81821233 14951727