Simple sequence repeat (SSR)
>UN04685 AGGTCGTAGAGGAGGGTGGAGAGGAGGGTGGAGGAGCAGAGCTTGTTGCCTAAGTGGAAGGAGAGGGAGCGGGTGAGTGAGGAGTGGGAGATGA TGGTTGAGTAGAGGTAGGATGCGAGTGCTGGTTCGGATTCTGCGTCTCGGCGTGCTTCGGCTTTGATTTGGGCCCAGACCCAGTCTGGTGATTC GGTAGTTGGGGTGGTTCCGTTGGATGTGACGGTGGTGGTGGTGGTTCCGTCGGTGGGTGGGTTTTGTTGTATTGGCATGGTGTTTGTAGAAGGT GAATGTGTGGGTAAGAAGATGGTGATCAAGTTGAAGTGTTTGTGTTTGTGT |
Primers for UN04685 SSR
Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
1 | GCCTAAGTGGAAGGAGAGGG | 60.204 | 20 | TGCCAATACAACAAAACCCA | 59.826 | 20 | 218 | 48 | 265 |
2 | GGTGAGTGAGGAGTGGGAGA | 60.243 | 20 | TGCCAATACAACAAAACCCA | 59.826 | 20 | 194 | 72 | 265 |
3 | GTAGGATGCGAGTGCTGGTT | 60.285 | 20 | TGCCAATACAACAAAACCCA | 59.826 | 20 | 158 | 108 | 265 |