Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN73821
GACGATGATATCAAATGGGACTCACAATGATCGTGCTATGAAGCAAATTCATGTGTAATAAATCTTGTATGATAAGGTCTATCACGTGACTACG
CATAGCTAACCTAAATAAACTGCACAGTCAAAACTAACTCCCGAGTCAAAAACTCTAGGTTCGTCTTTGTTTTCTTCTATAGAAAGGATCCACC
CAGGTCGTGTCTTCTTTCACTGCATTTTCCCATCGTTGTTTGAATATTTGAAGCTCAGTTGTTGATTGCCTTCTTATCTCAGCTCGGACATCTA
CAGCATGTTTCTTCAACAAATCCACATGATCAACAGTCTTTTTAGCAGAAGCGCCACCTAAAGTTTGTATTCCTTGATGAACAATAAATTCGCT
ATCAACAACTCCTACCTTCTTCGACCGGTCCCCCTGTGCACAATAGCCAAGTTTCATATCCATCCCCCATCCGTGAACAAGATCATTCTGTATA
AGATGCCAAGCACAATGCCAAGCAGCTCTGGAGAAAACTGGAGCCATTCCTTCTACAAACCCAGAACATGGTGGCCCCTCACTGTCATCTGAAC
ACTTCACACTACCTCTGCTGTCATACACTCTCCTATGAAATTTATTTGATCTCTTCCGTATTGTAATCCTGTGATGTATATCAGTTGAATTTGG
ATCTAATGCTGGCTGTGATATCTCTAGCCCTTCTGTTTTAACAATATTCAAGTACCTTTTGGGATTAAAATGTTGCACTCCTAGGTCTTCATCC
CAGAGAAATATATAATCATAAATGGACACAGCAGCAGGATGCAGAAATCGTTTTGCAAACCACCACTTTGTTTGGTTCTGAGCAACAATATGTA
TGACCTTGTTATTCCACTCAAGATCCCGCCAGCCATCCATTCTCCCATCATAATGGAACAAAATAATCGTAAAATTTGCTTCAAGAAACTTTTG
AGCGATGATATTAACATTCCGCTTCTGTTTTAGACCCACTGGCATTGCCAGCAAGTTATGAGAACTGGTATCATTAGCCTTCAATTTTGAACTA
CTTGTTGACCACAAAGGTTTTAATTCCAAGTCAGATTTATCTGCAATAATTCCACGTGGTAAACTCTTCAAGCTTGTTGAAGACGACACAGCTT
CCTTTGATGTGTAGAACCGATATAATTTTGAATCCAGCTCTGTCTGTATGTATTGATAATTTGTTGTCCTATATACAATGTATAACATTATTGT
ACAAATTAATCCCATAAACGGCTTCATACTGAATTTGCACAGTCCCCAATCAAAAATAAGTTGTCGTTTCCTCAAAAGATTCCTCCATTGTTTG
AATTCCTTCATAGACGAATATTGGTTCTATATCTTCTCATTCCAAACAATTAGATTCGAACACGAATGAGTAAACTGAGAATAAAATAATCTGA
GCAGCAGCAGCAGCAGCAGC
TGAAGAGTAAAGTTTTTTATTCGGTACAATGAATAAATCCCGGTCGAATATTCCGGCGTGTTTTGCTATGTGTG
TGTATTTGTGTGTGTATATATAGATATTCGTATATTTTTAGAGAGAGAGAAAAAGAAAAGAAAGAAGGAGAAAAGTGTCGGAAATGAGGCTCTC
C

Primers for UN73821 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1ACTGAATTTGCACAGTCCCC 59.97320GGAATATTCGACCGGGATTT 59.98420235 12501484
2ACTGAATTTGCACAGTCCCC 59.97320CGACCGGGATTTATTCATTG 60.14620227 12501476
3ACTGAATTTGCACAGTCCCC 59.97320CACACATAGCAAAACACGCC 60.1820255 12501504