Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN03931
GAAAACTCGAATAAATTATAATTCACCTAAACCGGTACAAAATACGATTAAAAATTAACCCAAATGTTAACTAACAACAACAACTAGAGAAATT
ACATCGAGAAAACATTTCTCAAAATGTTGCTAAAAAATTACTATTTACAGCGCTGACGTCATCAACCCAAACACAGATCCAACTCAAAACAGCT
CAGCAGGTGGAGGCAGGTTCAGATCTAACCCGACCCGTTCCTTCACGGGCTTCACATCAACAACAGACGACGAATTCGAGTCGTCGCTAACAGA
CTGACGAAAAACAGGAACCTGACCAGAATACAATATCCCGTTGTAGTAAAACATCTGAGGCGCGAAAAAACCGGTCACCGGTGGAAACCGGTAC
ATGGGCATGTTCTTAACCGGTGGAACAACGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTACGATGATGATAAGTTGAGATCTAGCGACGGTT
CTGTGGTGGTGGTGCTTCCTTGGCTTGTGCTTTGTTGTTGGTTAGTACTTTTTTTAATGCTTTGTAATTTTACAAAGGTATGGGAATTTATATT
AGTTATTTCTTGGGGGAAATTGGTCTTGGCTTTGCAGCCGCGAAACTCACGCGCGGCTGCATCGTACGCTCGAGCGGCCTCTTCGGCCGTATCG
AACGTACCAAGCCAGACACGGCTTTTTTTCCCGGGGTCGCGGATCTCGGCCGCGTAACGGCCCCAGGGGCGTTTCCTCACGCCTCTGAAATGGG
CTTCTTTGGTCACTGCTGGTGCATTGGTTGGTGGGTTTGGTTTAGAGGGTGTGTTTTTAGGAGACATTGGAGAGTATTTTGTTTTTGTTGTTGG
TTA

Primers for UN03931 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CGTCGCTAACAGACTGACGA 60.19920CCACAGAACCGTCGCTAGAT 60.27720207 270476
2TCGTCGCTAACAGACTGACG 60.19920CCACAGAACCGTCGCTAGAT 60.27720208 269476
3TTCGAGTCGTCGCTAACAGA 59.7420CCACAGAACCGTCGCTAGAT 60.27720214 263476