Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN69958
GTTGGTGGAACTTAAATATCATGATAACAAAAAGAAAGAAAAAGCCAAACTATATGCAAAGCAATCTTACAATCACTTTCAGATTTGATCTACA
GATGAAAATGTTTGGTGACTCTTCAACTATGTCCCGATTGATGTACTTTCTGTAAAGCTTGGTAGAACATGTCGATGAATTGGTTGTCCTGTGA
AAGCAATACAAGTGCATCTCGTACTTTTTCTCTGGTCAACGGTCCATAAAATGGAGCAGAAGTGGAGGAAGGAGTAAGTGATGGTGGTGGTGTG
GGTGGCGGAAATGGTTGAAGCAAGGGAATACCAACATTTCTTTGTACATTAAGGGGCGGCTGAAGTGTGGTAACTGGCATGGATGAAGAAGGCT
GTCTCATCAATGGTGATGAAGAAGAAGAGGGTGTAAAGAAAGAAAGGGGCTTAATAAGATTAGTCAAATGATTGCTGCTGTTGACCAGGTCGAC
ATTGTCATGGTGAGGCATTGGTGGGGTGGATGATGGGTTCGGTAATGGTTGACCATTGATCATGGGAGAAGGTATATCACGAGAAGCTAAAGGA
ACTGTTGAGTTATGGTACGATGGAATAGAATTAACCGGATTTTGAACATTATTATGTCCCAGATTCATAGCATTACTGAAGAAGTTCACAAATG
ACGAATCCTCAGGTACGTCTGTGGTGCGTGAGGAAGTCAACCCTGGCTCCAATGGTCCTTCAATTACAGCAGAGGTAGGTACGGCTTCAAGTTC
CTCGAACTCGCTTTTGTTCACTTGCTGCTTGGGGGGAACCTTTGAATATGCACCAAGTATCCTGGTAAACAGGTTAGCAACATCCTCACACTCA
CGTGTATTGTAGAACCAAATACCGTTAACTTCTTGAGAAGCATTTCGGTATAGTAGATACGGAACTTGAAGTTCAAACTCAAAATCTCCCAGGA
GATTCTCCACAAGGTTTTCTGTATTTCTTCGATTCATTACTATAAACTGGAACCTCGGTTGAGTGTTTCTCTTAACGACAAATAGAGACCCTTC
AACATCCTTGCGACTCCATTGATTCAATTCAACATTGAATTCATAAAAAGTGACATGAGCAGCAGTGATTAAGATCTCTTCAATAAAAGGATCC
ATTCTTTGAAGAACAGTAAGATTAAGGATTTTGGTACTGTTTTGATCTATGTTTGGCATTAATTTACCACCTTGTTGTTGCTGTTGTTGTTGTG
ACATTTTAATTATTTTATTTTTTGATTTTGAGGTGTTTGTGTTTGTGTTTGGAACCCTAAAAACTAAACTAAACCCAGTGACAAAGATTAGTCT
GTGTGTGTGTG
TTTAAAGAGATCGGGTCGGTTGAGG

Primers for UN69958 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CCACCTTGTTGTTGCTGTTG 60.1920CTCAACCGACCCGATCTCT 60.20719157 11951351
2CCACCTTGTTGTTGCTGTTG 60.1920CTCAACCGACCCGATCTCTT 61.55320157 11951351
3CCACCTTGTTGTTGCTGTTG 60.1920TCAACCGACCCGATCTCTT 60.60619156 11951350