Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN03583
TTAATTATAAATATTTTAAGATTTAAAATATTTTCATTCCACATTGATACGAAACAAAACCTCACTACGGAAATGAACAACAAGTTTTACATGA
TACAATTTTTCGAGTTTTCGAATTATACCTCAACTCAACTCGGTCTTTAATAACAATCACACACTGACGTTATCCACACTATCCATGCATTGGA
CAATTCACAAGCTACATACAACACAATATAATCCATGCAAACTTTACAATTTTACACAATTTTACACCATTAAACAGTAGACCTTTCTAGTTGC
CACCACCACCGAACCCACTACCAGTTCCAACACCACTACCGCCACCTTCACCCACTCCTACTCCGACACCCACGCCTCCACCGACGCCATGACC
GCCACCACCTCCCAAGCCTCCTCCACCACCTCCTCCTAGGCCTCCGGCACTTCCTCCACCTACACCACCACCAGCTCCAAACCCTCCGCCATGA
CGTGCACCTCCTCCTAAACCACCGCCTCCGCCGCTACCTCCACCACCACCACCACCGACACCAACACCACCAGATGATGATGATGATTGCATCA
AGAAATTATCCGGTGACGATGACGGTGATGATAATTCCATCCTCCGATCTAATAACTTATTACAATTCCAATAACTATTATTATTATTATCCAC
ACTCTGCATATTCTCCAATTATCACCATCTGTATCAATAACAAACCCTAACCCTAACGGTAACGGAACAATTGTCCGTACATTATAACAATAAT
CACATAAACAGATGATGATTGATTAATTAATTGATAATGAATGAATAATGAAATTGATTAGATCTGATGATGAAATTAGACGGTGGATCTTTTG
TGTGTGTGTG
TAATTGCGTGTGTATGAAAAAGATATGAAAGAAAGAAAGAAAGAATTTGGGGGTGATGGTGATGATGAAGGTGAATTGCTT

Primers for UN03583 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1CCCTAACGGTAACGGAACAA 59.85520ACCATCACCCCCAAATTCTT 60.42220208 709916
2CCCTAACGGTAACGGAACAA 59.85520CATCACCCCCAAATTCTTTC 59.2220206 709914
3CCCTAACGGTAACGGAACAA 59.85520CCATCACCCCCAAATTCTTT 60.9120207 709915