Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN65348
TTTTTAATATGAATAAGTAAATTGTCTATATTTTTCTAAGCATTCGATACATGTACATATATATATATATATATATGTTTCTAACCGATGCAAT
CTAAACATCATGATGGTTCGGTTTGTAACCGCCATCCATAACCATTTTTCGGTTATTATGTTTCTAGTTGACGAGTTTAGTCCTTCGTCTAATA
ATATTTACATATGAAGCATAAGGATTAAGATTATTGGTTCTTTTGGATACTTATACAAATGCACACACTCATAACAACAACAATGCACAATTAA
TCCCGCCGGAGCGAGGTATGAAGGTATGAAATAATGTAGACAGTCACACCCATACCCCGTGTGGGTAAAGGGACTGCTTTAGAAACACACACTT
ATAAGTTCTTATCATATCCTTTGGACAAAACAGCAGTCTTGATCAAGTGGAAGGAATGTTGAAGATCATCACACAACTTCTCAGGGTCGGGTAT
AGTTTCTTCATCGACGGCTACCACTAAAGTCACTTTGTCAACATAACTAACCACATGAATGCTTAGTGCCGTGGATAGGCCGTAGAATGTTCCA
GCAAGGTAGGAAACTTCATGTCCAAAAAATAATATTTCTTCTTGTGGCCCGGGGACATTAGATAAGCAGAGTGTTGTGCTCGAGTAAACTTTGC
GGTTGAGTTTTCCTGCAATCTTATAACCGAACAACTTGATGACTATATTAGCAACAAAACCAGTCCAAAAAGGCTCTAAAGAAGCTTTCTTGCG
ATCTATGGTGGTCTTGACATCTCTTACATGATCTAATGGATCTTCTCTGAGTCTCATGTTTAGTGGAAGTAAAACATGACCTACCTTGTTTCCC
CATTCTCCATGACTGCTAGTCGTATTAGCGAAAGCATCGAACGTAGTGGAGGCTCGCAGGTTAAATACAAGTATTGCACGTAGTCGAATGTTCT
CTCCTGCTCCATATGTTCGCTTTAGGTAGCGGGATAAGCCAGCTTGTATAAATCCAACTACTACGTCGTTGACTGTAACATCCATAGCTTTTTT
GACCATCTTTATATCATTAAGGCTAACACTTCCAAGGACAAAGCGTCGTGGCCTATCCTCAATTCCTGGGTAGCCTTTTAAAGGTGTTTCTGTG
TCTTTTAGAAACAATGCAGTCAAAATGAACATGACAAAAGCCACAAAAGAGTTCCAAAGGACGATAAATAGGGATATTAGATTAGTAATTCTTA
TATGACGACCGGACACCTTATTACTGGGAAGAGTCGGCAAGGCCTCATGGTCTGAAACCTTGCGACTACAAGCCAACATAAAATTCATCAAAGA
CAATCCATCACCGAGCGAGTGATGAACACGGATGATGCATGTGCCTGATGTCTTTGTGTTGAGAATATGTACATCCCATAACGGTTTTGAGCTA
TCTATGCTTGATCTACTAAGGTCTGTGATATACTCCTCAACGAATTTGTCAGACGACTTTAGACGTGGATCAATTTCAGGCACAATGATATGGT
TATCTATGTTTACACGTGTCGGAATCCATTTCATGTTCCCGTTTTGTTTGTCCAGAACCTGCAAACTAGAGAAGCGATGATTTTTTTGTATTAT
ATGAACCACGTCGGCTTTGGGAAGATCTGGATCGATTGGAGTTTTCAACCCGATGATAGCGAGCATGTACATATTACCACCAGGCTCGTGAAAC
AACCTAGTCATAGGACTCGATGGCTGTTCTTGATAATCTAATATTTTTTGATCTTTGGTGGTTTGGATTTTCTTAAGAGGGTTCAAACTTGGTG
TTCTATCCATGATGTTTGATG

Primers for UN65348 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1TTGTCTATATTTTTCTAAGCATTCGAT 58.13827ATGGTTATGGATGGCGGTTA 60.03820118 22139
2TTGTCTATATTTTTCTAAGCATTCGAT 58.13827CGGTTACAAACCGAACCATC 60.22720104 22125
3TTGTCTATATTTTTCTAAGCATTCGAT 58.13827AAAAATGGTTATGGATGGCG 59.6620122 22143