Simple sequence repeat (SSR)
| >UN62961 ATGGAGCCTTTGAACATGTCAATCTTAGCATTACGGATTATCACAGTATTTCCAGCCTTCATCAAGTCAACTTGATCATTACGAGCAGTAAACA AAATAGTCCCAGTTTCATCACCAATCAAACACTCAGCAATCCTACCACCACCACCACCACGTCCACCACTAAACGAAGACCTTGTTTTCTTATC CATGACAGTTGTTGCTGTCAAAACCTTAACAGCAAGTGTATGTCCATTAGTCCCAGGTTTCAAATCACCCACCTTAACAAACACTGGTTTCCTC TTCACAACTGCTGGTCTTTGTTGTTCTGGTTGCTTGGTTTCTGTGTTTGGGGTTGATTCGTTAGGTGTTGACATGTTTGCCGTTGGTTTGGTTT GGTTTGATGGGATTGTGTGTGTTTGTTGATAAACCCTAACCCTAGGATGGAATTTAATTATGTTTGGTGGGTGTGTGTTGTGGTTTGGGGGTTT TGTGTTTGGTGTG |
Primers for UN62961 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | TCCAGCCTTCATCAAGTCAA | 59.369 | 20 | GGTGGGTGATTTGAAACCTG | 60.21 | 20 | 211 | 51 | 261 |
| 2 | TCCAGCCTTCATCAAGTCAA | 59.369 | 20 | GTGGGTGATTTGAAACCTGG | 60.21 | 20 | 210 | 51 | 260 |
| 3 | CCCAGTTTCATCACCAATCA | 59.343 | 20 | CCTAACGAATCAACCCCAAA | 59.795 | 20 | 246 | 102 | 347 |