Simple sequence repeat (SSR)
| >UN55004 TAATCTTTCTGATGGATCAATCTGAGAAACTATCTCCTGGATACTTCTCTTGCTTATAATTCTGTTACAAGTCTCGGTAGCCTCCACAACAGCT GGTGGTCTGTTAAATGTAGGTGGTGGTGGAGCTGGACTAGTAGGCTGTGCAACAGTTTGACTGAACGGTCTTTGGTTCCCCAGTCCACGGTTCC TAGCCAACTGTTGTTGATGGGGGGTCAAAGTGTGTGGTACTCGTGATGGTGGTAATGAGTACTGCTCTTGTGGCTGCTGCGATAACGACGATGA TTGTGGCTGTAGAGAGGAAATTGTTTGAGGTGGTTGTGTGGGTGTTGAGATTGTAGTTTGTTGTTGAGATGGTAGGTGGGGTCTTTGTTGTAAT GATTGTGAGTTCATTGGTGGTCTAAATGATGGATGTGGCATGCTAGGCCTTGCTTGCGGTCCGGAGTTTAGCCATGGTTGAGTGCTTTGTGATG TCGTAGGTGCAGGTGAGGCTGTTGATGGAAGTCTTACATGACCGTGCTCTGGGAAATTTTGTGCAGCTGCTGACATATTATTAGCAGCAGTCTG CGGTCTAAGCGAAGGTTGGATAGGTCTTTGTGGATGTGACAAAGCAGCAGTATTCGGCCGCAATGAAGACCCTGCACCAAGTGATCCCATCATT CCCGCTCCCTGCATTCCAGTAATTGATTGCCTTACCTGGGGAGTAGTAGTGGCGAAATGCGAAGAAGTGAAAGGAGGTGGATTTAAAGATGAAA AATTGGGGTTAGGGTGTGGTGGTGGTGGTGATGGAGCTGGTACTCCAATAGCCATACCACCACTGACACCTCTTTGAGATGGTGTGATTGAAGA TGAAGGTGTTGTTGAGTGGTTGGTTATTGATGAGAAGTGTGGGAAGGGTGGTGGTGGTTGAGTGTATGGTGGGCCCCGTGGGAATGGTGGCCTT GGTTGTTGTTGTTGTAATGGAATTGGGGGTTTAGGGTTAGGGTTTGGAGTTGGGAATGGGGTGTCACGTGGTCTGCCACGACGGCGTTTGCGGG GGATGCCCAGAGAGAGGAGGTGGTTGAGGGTTTGATGGGTTTCGGTTGGGGGGTTCATTGGTGGGATTGATTGATACCAGGTGTGATGTTGTTG AT |
Primers for UN55004 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | AATGAAGACCCTGCACCAAG | 60.111 | 20 | CCCTTCCCACACTTCTCATC | 59.505 | 20 | 269 | 626 | 894 |
| 2 | TGCGAAGAAGTGAAAGGAGG | 60.508 | 20 | CCTAAACCCCCAATTCCATT | 59.882 | 20 | 260 | 716 | 975 |
| 3 | CAAGTGATCCCATCATTCCC | 60.135 | 20 | CCCTTCCCACACTTCTCATC | 59.505 | 20 | 253 | 642 | 894 |