Chrysanthenum transcriptome database

Simple sequence repeat (SSR)

>UN02117
GAGTTTGCTGGTGGATCCAACCCAGCTTGTTTTGCCTGGTATTAAAGCTTACACATGTTTGACCCAGACCCATCTTGACCCTTTCCTCAACCCG
CCCGTTCCAACAATTTTGGCAACTCTAGTTGAAGAGGTGGGATACTTGCCTAAATGATCAACGTCTAGTTCGAGGCTTGCACCGAAATTCAGCC
AAGAGTGCAATGTGATCAGATGACCATTCAGGAGAAGGAAGTGCCGTATCTTTCCTCAAGCTATCCTCCTCCAGTAATTCCAACAACGATTCCA
CTGTCAAGGTGTCCGCTGAGTAAAATATATAATCGAGTGTACCAATGAAGTCCCGCGTGCAATTTGTAAATAGAGGTTCATTTGTAGCAGGATC
CACTCTCCTCTTTTGTTGCTCATAACCAAGATTAGCTCCAATTCTTGCAAAAGATGAGTAGGCACTAACCAAAGGCAGGGTGTGAGTCAATTTA
GTAGCCGGTCTCAGAATTCCAAGAGGGTCTACGGCTAAATCCGGATGCATTGGATCAACTTTCCCGATTGCTAAAAGTGCATGAGGAGCACTTC
CAGGAACTGAATTAAAATCCCCACAGACTAACATTGGTATATCCGCACTCGCAGCTATCTTTTCCAAACCTTTCAACAAAGTATGAACCTGCCA
TAGTTTGACATCCTTTAAATCTTGTTGAACATTCACATGCGTATTTGCCACACAAACAAGTTGTCTCTTTCCTGGATTATCAACACCGTGGTTA
CTGAATTTCGCTTCTAGAACAACGATTAGAGCAACATTATCCTTGACCAACCGATTTAAAGCGGTTTTCTTCTGAGCACTAGGAACCAAAGCAT
CAGTTAAAGATTGTGCAGCTTTATTAAACTCAACCTCGTATTTTTTGACATGAGAAAATCTATCTCTGCGAAAGAATGTGGCACATCCATCAAT
AGTCATTATACTTCCGTTAAAAACCTCTGCTGTTTTTTTCTTATATAGAGCCTGATAGCCATGTTTGTCCAGCTCAGGAGCAAAAAACTCATCA
AAATGATCGCTTTGAACCTCTTGAAGACAAACAATGTCAGCTCGGTAGCCAACTATTTCCCGTAACAAATTCTGTCTACGGTAAGGCCAAGAAA
GGGCCCATGACGGACAATAACCATATAAATCACTCGTAGCATACGTATCCGCTAAAATATTATACGAGAGCACAGTAAAAGTCCCATTAGATGA
AAGACGTCCATCTAAATCCAGATGCCCCATGACATCAGAATTGCTAACCGAGATCAATTTTCGTGGACTCGGGGATGGAGCCGGAATCACACGT
GATGTCAATATGGTATTCGTGTGTCCAACGGGTGATTTCGTTTCTACATCAACCACCACACATTCAAACTTGAGAACATGACCGATGTCATCAG
CTGTTGGTGTATAAGTTTTAGACCGACCAACTTCAAACCATGTTTCACCACCGCTCCTCTGTGTCACAGCTGCAGGATATAAGGGTGTTGCACC
ATTTGCAAGGCTTGGAAGAGACTGTGAGCTTGATAAGCTTTGATTATTATTACTATTGTTGTTATTATTATTATTAAATCTTCCGAATATCTCT
TCTTCTTCATTTCCATTTTCATTAACAGCACTGGCAGCACGCTCATGTAGAACACGATGGTGTTGCCATGCATCAGAAAAACATTTTGGAGTGC
AATGGTAGCTTTTATTGACAGGTATTTTGGCTTTTACACACCCTAAGCACTGCAAAGTGGCTT

Primers for UN02117 SSR

Primer pairForward primer (5'-3') Reverse primer (5'-3')Product
SequenceTemperatureSizeSequenceTemperature SizeSizeStartEnd
1GCAAGGCTTGGAAGAGACTG 60.13420GCTGCCAGTGCTGTTAATGA 60.01920128 15091636
2TGCAAGGCTTGGAAGAGACT 60.13420GCTGCCAGTGCTGTTAATGA 60.01920129 15081636
3GCAAGGCTTGGAAGAGACTG 60.13420TTTGCAGTGCTTAGGGTGTG 59.90420240 15091748