Simple sequence repeat (SSR)
| >UN41789 TCCCACTTTATAAACACACTTGACTGCCTGGTATCAATTGGCTTAAGGTTCTTATTGGTTAAGGTGGCGGATCATCCACAGTGGCATCATGGTA GTGGAGACATGATGAGCTCGAGCTAATTCCTCCTCTCTCTCTCTCATGGCTGCTCCGATAAATGGTCTATATCTTTTGCTTGTTCTTCATGTTG ATCTTAGTGATAATCATATTGTTGTTGTGATTAAGATTGTCCTTCTTCGAGTCAGTGATCCAAAGATGATG |
Primers for UN41789 SSR
| Primer pair | Forward primer (5'-3') | Reverse primer (5'-3') | Product | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence | Temperature | Size | Sequence | Temperature | Size | Size | Start | End | |
| 1 | ACTGCCTGGTATCAATTGGC | 59.962 | 20 | AGACCATTTATCGGAGCAGC | 59.297 | 20 | 140 | 23 | 162 |
| 2 | TTATTGGTTAAGGTGGCGGA | 60.315 | 20 | AGACCATTTATCGGAGCAGC | 59.297 | 20 | 111 | 52 | 162 |
| 3 | TGCCTGGTATCAATTGGCTT | 60.469 | 20 | AGACCATTTATCGGAGCAGC | 59.297 | 20 | 138 | 25 | 162 |